MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p1ESCUM

Total Repeats: 2028

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011749	GTC	2	6	109	114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692795
2	NC_011749	TGACAC	2	12	126	137	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218692795
3	NC_011749	AAC	2	6	146	151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218692795
4	NC_011749	TACC	2	8	192	199	25 %	25 %	0 %	50 %	218692795
5	NC_011749	GAA	2	6	211	216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218692795
6	NC_011749	A	8	8	221	228	100 %	0 %	0 %	0 %	218692795
7	NC_011749	GAA	2	6	254	259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218692795
8	NC_011749	TGGATA	2	12	324	335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692795
9	NC_011749	TGGG	2	8	350	357	0 %	25 %	75 %	0 %	218692795
10	NC_011749	TCAT	2	8	360	367	25 %	50 %	0 %	25 %	218692795
11	NC_011749	TG	3	6	432	437	0 %	50 %	50 %	0 %	218692795
12	NC_011749	TCA	2	6	455	460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692795
13	NC_011749	CTA	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692795
14	NC_011749	CTT	2	6	662	667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218692795
15	NC_011749	AG	3	6	730	735	50 %	0 %	50 %	0 %	218692795
16	NC_011749	TTC	2	6	899	904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218692795
17	NC_011749	ATG	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692795
18	NC_011749	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	218692795
19	NC_011749	GCA	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692796
20	NC_011749	CCAG	2	8	1457	1464	25 %	0 %	25 %	50 %	218692796
21	NC_011749	TCG	2	6	1613	1618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692796
22	NC_011749	ACG	3	9	1639	1647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692796
23	NC_011749	GTG	2	6	1655	1660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218692796
24	NC_011749	ATC	2	6	1661	1666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692796
25	NC_011749	GGCG	2	8	1730	1737	0 %	0 %	75 %	25 %	218692796
26	NC_011749	CGCA	2	8	1747	1754	25 %	0 %	25 %	50 %	218692796
27	NC_011749	AGA	2	6	1896	1901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218692796
28	NC_011749	CACT	2	8	1908	1915	25 %	25 %	0 %	50 %	218692796
29	NC_011749	CAG	2	6	1924	1929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692796
30	NC_011749	TTC	2	6	1962	1967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218692796
31	NC_011749	TAT	2	6	2787	2792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218692797
32	NC_011749	GTC	2	6	2831	2836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692797
33	NC_011749	TGATG	2	10	2859	2868	20 %	40 %	40 %	0 %	218692797
34	NC_011749	TGT	2	6	2896	2901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218692797
35	NC_011749	ATTTTT	2	12	2929	2940	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	218692797
36	NC_011749	T	8	8	2936	2943	0 %	100 %	0 %	0 %	218692797
37	NC_011749	T	7	7	2952	2958	0 %	100 %	0 %	0 %	218692797
38	NC_011749	A	6	6	2985	2990	100 %	0 %	0 %	0 %	218692797
39	NC_011749	T	6	6	3021	3026	0 %	100 %	0 %	0 %	218692797
40	NC_011749	ATG	2	6	3034	3039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692797
41	NC_011749	TA	3	6	3066	3071	50 %	50 %	0 %	0 %	218692797
42	NC_011749	CTGG	2	8	3119	3126	0 %	25 %	50 %	25 %	218692797
43	NC_011749	GTT	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218692797
44	NC_011749	ATA	2	6	3172	3177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218692797
45	NC_011749	ATA	2	6	3215	3220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218692797
46	NC_011749	ATCT	2	8	3247	3254	25 %	50 %	0 %	25 %	218692797
47	NC_011749	ATTTT	2	10	3386	3395	20 %	80 %	0 %	0 %	218692797
48	NC_011749	TGA	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692797
49	NC_011749	TAT	2	6	3494	3499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218692797
50	NC_011749	TTA	2	6	3551	3556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218692797
51	NC_011749	ATT	2	6	3595	3600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218692797
52	NC_011749	GGA	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218692797
53	NC_011749	T	7	7	3625	3631	0 %	100 %	0 %	0 %	218692797
54	NC_011749	A	8	8	3649	3656	100 %	0 %	0 %	0 %	218692797
55	NC_011749	GAA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218692797
56	NC_011749	GAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218692797
57	NC_011749	GCA	2	6	3826	3831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692797
58	NC_011749	T	6	6	5664	5669	0 %	100 %	0 %	0 %	218692798
59	NC_011749	CTT	2	6	5689	5694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218692798
60	NC_011749	T	7	7	5716	5722	0 %	100 %	0 %	0 %	218692798
61	NC_011749	GCA	3	9	5760	5768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692798
62	NC_011749	CAG	2	6	5806	5811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692798
63	NC_011749	CCT	2	6	5821	5826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218692798
64	NC_011749	TTGC	2	8	5831	5838	0 %	50 %	25 %	25 %	218692798
65	NC_011749	CTGG	2	8	5852	5859	0 %	25 %	50 %	25 %	218692798
66	NC_011749	CAA	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218692798
67	NC_011749	CTG	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692798
68	NC_011749	GTA	2	6	5943	5948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692798
69	NC_011749	ATCA	2	8	5978	5985	50 %	25 %	0 %	25 %	218692798
70	NC_011749	TTC	2	6	6345	6350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218692799
71	NC_011749	GTC	2	6	6427	6432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692799
72	NC_011749	GGAC	2	8	6517	6524	25 %	0 %	50 %	25 %	218692799
73	NC_011749	CTTGTT	2	12	6571	6582	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218692799
74	NC_011749	GCA	2	6	6736	6741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692799
75	NC_011749	C	6	6	6751	6756	0 %	0 %	0 %	100 %	218692799
76	NC_011749	GA	3	6	6758	6763	50 %	0 %	50 %	0 %	218692799
77	NC_011749	GTG	2	6	6797	6802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218692799
78	NC_011749	CACAG	2	10	6805	6814	40 %	0 %	20 %	40 %	218692799
79	NC_011749	GC	3	6	6912	6917	0 %	0 %	50 %	50 %	218692799
80	NC_011749	ACAG	2	8	6970	6977	50 %	0 %	25 %	25 %	218692799
81	NC_011749	TCA	2	6	7133	7138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692799
82	NC_011749	CAA	2	6	7191	7196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218692799
83	NC_011749	ACA	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218692799
84	NC_011749	TGT	2	6	7236	7241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218692799
85	NC_011749	AGTTA	2	10	7280	7289	40 %	40 %	20 %	0 %	218692799
86	NC_011749	CAG	3	9	7309	7317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692799
87	NC_011749	GGAA	2	8	7347	7354	50 %	0 %	50 %	0 %	218692799
88	NC_011749	TCG	2	6	7421	7426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692799
89	NC_011749	GCG	2	6	7501	7506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218692799
90	NC_011749	TGA	2	6	7532	7537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692799
91	NC_011749	GAT	2	6	7594	7599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692799
92	NC_011749	CG	3	6	7781	7786	0 %	0 %	50 %	50 %	218692799
93	NC_011749	TTCTTA	2	12	7806	7817	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218692799
94	NC_011749	GGGAT	2	10	7842	7851	20 %	20 %	60 %	0 %	218692799
95	NC_011749	ATT	2	6	7874	7879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218692799
96	NC_011749	CAG	3	9	7923	7931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692799
97	NC_011749	AC	3	6	7958	7963	50 %	0 %	0 %	50 %	218692799
98	NC_011749	TCA	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692799
99	NC_011749	GGA	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218692799
100	NC_011749	GCA	2	6	8032	8037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692799
101	NC_011749	A	6	6	8050	8055	100 %	0 %	0 %	0 %	218692799
102	NC_011749	GGCT	2	8	8070	8077	0 %	25 %	50 %	25 %	218692799
103	NC_011749	CAA	2	6	8160	8165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218692799
104	NC_011749	ATG	2	6	8245	8250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692800
105	NC_011749	AAC	2	6	8341	8346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218692800
106	NC_011749	GCAA	2	8	8500	8507	50 %	0 %	25 %	25 %	218692800
107	NC_011749	AT	3	6	8532	8537	50 %	50 %	0 %	0 %	218692800
108	NC_011749	ATG	2	6	8600	8605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692800
109	NC_011749	CAG	2	6	8659	8664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692800
110	NC_011749	ATC	2	6	8826	8831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692800
111	NC_011749	TGGC	2	8	8941	8948	0 %	25 %	50 %	25 %	218692800
112	NC_011749	TG	3	6	8987	8992	0 %	50 %	50 %	0 %	218692800
113	NC_011749	CAG	2	6	9240	9245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692801
114	NC_011749	CTC	2	6	9257	9262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218692801
115	NC_011749	CCGAA	2	10	9269	9278	40 %	0 %	20 %	40 %	218692801
116	NC_011749	CAGCC	2	10	9347	9356	20 %	0 %	20 %	60 %	218692801
117	NC_011749	ATC	2	6	9357	9362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692801
118	NC_011749	CAGC	2	8	9456	9463	25 %	0 %	25 %	50 %	218692801
119	NC_011749	CAG	2	6	9477	9482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692801
120	NC_011749	CCG	2	6	9521	9526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218692801
121	NC_011749	TCC	2	6	9583	9588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218692801
122	NC_011749	TCTG	2	8	9816	9823	0 %	50 %	25 %	25 %	218692802
123	NC_011749	TTTGA	2	10	9841	9850	20 %	60 %	20 %	0 %	218692802
124	NC_011749	GTG	2	6	9862	9867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218692802
125	NC_011749	TGC	2	6	9898	9903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692802
126	NC_011749	GAA	2	6	9994	9999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218692802
127	NC_011749	CTT	2	6	10008	10013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218692802
128	NC_011749	CTGA	2	8	10015	10022	25 %	25 %	25 %	25 %	218692802
129	NC_011749	TCA	2	6	10040	10045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692802
130	NC_011749	ATG	2	6	10046	10051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692802
131	NC_011749	G	6	6	10059	10064	0 %	0 %	100 %	0 %	218692802
132	NC_011749	CGT	2	6	10084	10089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692802
133	NC_011749	CTG	3	9	10137	10145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692802
134	NC_011749	TGAG	2	8	10266	10273	25 %	25 %	50 %	0 %	218692802
135	NC_011749	CCG	2	6	10344	10349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218692802
136	NC_011749	TGA	2	6	10388	10393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692802
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138	NC_011749	TGT	2	6	10463	10468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218692802
139	NC_011749	GCGCT	2	10	10479	10488	0 %	20 %	40 %	40 %	218692802
140	NC_011749	CAT	2	6	10549	10554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692802
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143	NC_011749	TCA	2	6	10633	10638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692803
144	NC_011749	T	6	6	10656	10661	0 %	100 %	0 %	0 %	218692803
145	NC_011749	CTG	2	6	10686	10691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692803
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159	NC_011749	GCGA	2	8	11328	11335	25 %	0 %	50 %	25 %	218692803
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163	NC_011749	CCG	2	6	11748	11753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218692804
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167	NC_011749	CAG	2	6	11917	11922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692804
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169	NC_011749	CAG	2	6	11950	11955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692804
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258	NC_011749	GC	3	6	19744	19749	0 %	0 %	50 %	50 %	218692810
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260	NC_011749	GT	3	6	19916	19921	0 %	50 %	50 %	0 %	218692810
261	NC_011749	CG	3	6	19952	19957	0 %	0 %	50 %	50 %	218692810
262	NC_011749	CTG	2	6	19992	19997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692810
263	NC_011749	TCGA	2	8	20023	20030	25 %	25 %	25 %	25 %	218692810
264	NC_011749	CGCC	2	8	20051	20058	0 %	0 %	25 %	75 %	218692810
265	NC_011749	TGC	2	6	20099	20104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692810
266	NC_011749	TTG	2	6	20152	20157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218692810
267	NC_011749	CGTTA	2	10	20253	20262	20 %	40 %	20 %	20 %	218692810
268	NC_011749	AATT	2	8	20268	20275	50 %	50 %	0 %	0 %	218692810
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270	NC_011749	ACG	2	6	20328	20333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692810
271	NC_011749	ATTT	2	8	20339	20346	25 %	75 %	0 %	0 %	218692810
272	NC_011749	GTCTG	2	10	20385	20394	0 %	40 %	40 %	20 %	218692810
273	NC_011749	AT	3	6	20434	20439	50 %	50 %	0 %	0 %	218692810
274	NC_011749	CAG	2	6	20513	20518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692810
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279	NC_011749	CGT	2	6	20802	20807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692810
280	NC_011749	TAC	2	6	20948	20953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692810
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283	NC_011749	T	6	6	21104	21109	0 %	100 %	0 %	0 %	218692810
284	NC_011749	AAT	2	6	21145	21150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218692810
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287	NC_011749	ACT	2	6	21507	21512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692811
288	NC_011749	ACG	2	6	21547	21552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692811
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296	NC_011749	TCT	2	6	21895	21900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218692811
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